LABORATORIO
DE
CHIPS
DE DNA
Personal y direcciones de contacto
Productos y servicios ofertados
Publicaciones y datos experimentales
Introducción
Los
avances en los proyectos de secuenciación de diversos genomas (finalizados
en varios organismos) han profundizado la exploracion en la investigación
biológica. Paralelamente al avance en el conocimiento de la secuencia
de los genomas de los diferentes organismos, se hace esta desarrollando,
entre otros aspectos, el análisis funcional de dichos genomas. Con
ese fín, una de las tecnologías más interesantes es
la de los Chips de DNA, Series de DNA ("arrays"), o tambien llamados "Biochips".
Esta tecnología permite el análisis de un gran número
de genes simultaneamente. Hay varias modalidades en función del
soporte utilizado así como de la densidad a la que se depositan
las sondas: Macroseries, si el soporte utilizado son filtros de nylon y
a baja densidad, o bien Microseries, si hay una alta densidad de sondas,
normalemente dispuestas sobre soporte de vidrio.
En
esta Sección, integrada en el Servei Central de Suport a la Investigació
de la Universitat de València, se desarrolla la tecnología
para la fabricación de Macrochips (filtros) de DNA, basada en la
utilización de productos de PCR específicos de cada gen que
se fijan sobre filtros de Nylon mediante un sistema robotizado a una densidad
de 75 muestras/cm2 y permitiendo analizar el genoma completo de un organismo
o un número muy elevado de sus genes en un solo experimento. Se
dispone también de un robot para la fabricación de "Microseries"
(microchips) en soporte de vidrio. En el laboratorio se comercializará
el Chip de DNA con el genoma completo de levadura, y además se ofrece
un servicio de Chips "a la carta" en el que se diseña el array en
función de las necesidades del cliente, bien depositando las sondas
que facilite el usuario o generando los correspondientes productos de PCR.
Además de la fabricación propia de los Chips, también
se procederá, en su caso, al análisis de los mismos, pues
se dispone del software necesario para ello. También se ofrecen
servicios adicionales relacionados con el diseño y la preparación
de las sondas a imprimir.
También
se va a construir una base de datos sobre experimentos de Chips de DNA
en levadura, que contenga todos los datos posibles sobre experimentos de
expresión en diferentes condiciones, que se podrá consultar
on-line desde la dirección electrónica del laboratorio y
que estará integrada en la CYGD (Comprehensive Yeast Genome Database)
que tiene el MIPS en Munich.
Personal y direcciones de contacto
| Asesor científico: | Dr. José Enrique Pérez Ortín | Jose.E.Perez@uv.es |
| Técnico Superior (Responsable): | Dr. José García Martínez | Jose.Garcia-Martinez@uv.es |
| Técnico Especialista: | Dra. Pilar Ruiz Vázquez | Pilar.Ruiz@uv.es |
Dirección postal:
Sección de Chips
de DNA-S.C.S.I.E.
Edificio de Investigación,
planta baja
Campus de Burjassot
Universitat de València
C/ Dr. Moliner, 50
46100 Burjassot, Valencia
España
| Teléfono: |
|
| Fax: |
|
Enlaces interesantes
Bases de datos de levadura:
Páginas con datos de expresión en levadura (microarrays):SGD
ExpressDBYeast Cell Cycle Analysis Project
Última actualización: Enero 2008
(c)
Laboratorio de Chips de DNA (S.C.S.I.E.)
Departament
de Bioquímica i Biología Molecular (Secció Biologia)
