EQUIPAMIENTO DEL LABORATORIO
ROBOT DE IMPRESIÓN DE MACROCHIPS:
Modelo: BioGRID de BioRobotics
Características:
- Deposita hasta 60000 muestras sobre cada una de las 4 membranas de nylon de 22 x 22cm en 1 hora
- Cabezales para impresión de 96 y de 384 pins sólidos
- Puede usar placas de 96 y 384 pocillos
- Banco de muestras con capacidad para 24 placas
ROBOT DE IMPRESIÓN DE MICROCHIPS:
Modelo: MicroGRIDII de BioRobotics
Características:
- Deposita hasta unas 10000 muestras sobre cada portaobjetos de vidrio
- Incluye circuito de refrigeración/humidificación en la zona de las placas para reducir la evaporación de las muestras
- Densidad de impresión programable en intervalos de 10µm
- Puede fabricar mas de 100 microchips en un solo proceso, usando hasta 24 placas de muestras de origen
- Posibilidad de usar placas de 96, 384 y 1536 pocillos
SCANNER PARA LA LECTURA DE MACROCHIPS:
Modelo:FLA-3000 de FUJIFILM
Características:
- Area de scanning hasta 23 x 40 cm
- Resolución de pixel de 50/100/200 µm
- Configuración con 2 láseres para radioisótopos (método IP) y fluorescencia
- Rango dinámico de 5 órdenes de magnitud
- Sensibilidad: S 4,000 para radioisótopos y F 1/10/100/1000 para fluorescencia
SCANNER PARA LA LECTURA MICROCHIPS:
Modelo: ScanArray LITE
de Perkin-Elmer
Características:
- Resolución de pixel de 5 µm
- Configuración con 2 láseres para longitudes de onda de 543 y 633 nm
- 4 filtros de emisión
- Sensibilidad hasta < 0.1 molecula/µm2
- Area de scanning de 22 x 73 mm (< 5 minutos)
ROBOT PARA FABRICACION Y LECTURA DE CHIPS
ELECTRONICOS:
Modelo: Nanochip de Nanogen
Características:
- Capacidad de fabricación: 4 nanochips (100/400 posiciones por chip)
- Densidad de impresión: 109 moleculas/punto
- Posibilidad de aplicar condiciones diferentes de hibridación para cada muestra (punto)
- Hibridación pasiva o electrónica en minutos
- Estringencia térmica, química o electrónica
- Incluye circuito de refrigeración/humidificación
- Configuración con 2 láseres con para longitudes de onda de 532 y 635 nm con lectura individual para cada posición
- Las aplicaciones son SNPs y STRs, estando en desarrollo la aplicación a estudios de expresión génica
ROBOT MULTIPIPETEADOR PARA MANEJO DE LIQUIDOS:
Modelo: Multiprobe II de Perkin-Elmer
Características:
- Robot para el manejo automatizado de líquidos con 4 puntas dispensadoras
- Volumenes de manipulación de nL a mL
- Utilizar microplacas de 96 y 384 pocillos
- Posibilidad de usar puntas desechables o fijas
- Dispositivo de autodetección del nivel de líquido
- Alta versatilidad debido a su configuración modular
2 TERMOCICLADORES:
Modelo: GeneAmp® PCR System
9700 de Applied Biosystems
Dual 384-Well
GeneAmp® PCR System 9700
SOFTWARE:
-ArrayVision 7.0: Programa para la lectura de la imágenes tanto de macro como de microarrays.
-ArrayStat 3.0: Programa para la normalización y validación estadística de los datos y réplicas.
-ScanArray 3.1: Programa para escanear los microarrays.
-QuantArray 3.0 y GenePix Pro 4.0: Programas para la lectura y el análisis de los datos de microarrays.
-Cluster 3.0: Programa desarrollado por Stanford University para el análisis de agrupamiento de perfiles de expresión.
-TreeView 1.60: Programa desarrollado por Stanford University para visualizar los resultados del programa anterior.
-Pride: Programa para el diseño masivo de oligonucleótidos en secuencias de genomas completos